Rezerwat utworzono w celu ochrony krańcowego stanowiska cisa. Jest to najbogatsze skupisko tego gatunku na Mazurach. Cis podlega tu ochronie od 1937 roku. Teren rezerwatu to głęboki wąwóz jeden z kilku wciętych we wzgórza zwane „Guzem” 256 metrów n.p.m. Bogata konfiguracja tutejszego terenu powoduje występowanie maleńkich zagłębień bezodpływowych wypełnionych wodą, lokalnie zabagnionych, oraz licznych strumieni o znacznych spadkach.

Cisowy Jar jest największym i najdłuższym wąwozem na terenie Wzgórz Szeskich. Długość wąwozu to około 1000 metrów, głębokość do 30 metrów a szerokość 100-300 metrów. Zbocza wąwozu są bardzo strome.

Przy wschodniej granicy rezerwatu znajdują się, ledwie już zauważalne wały ziemne - pozostałości po grodzisku z okresu kiedy ziemie te zamieszkiwali Jaćwingowie z sudawskiej grupy Kymenów. Okoliczni mieszkańcy grodzisko nazywali „Stary Szaniec”.





Zdjęcie: Kpjas at pl.wikipedia, CC BY-SA 3.0 , via Wikimedia Commons