Muzeum prowadzone jest przez Uniwersytet Mikołaja Kopernika w Toruniu.

Na muzealną ekspozycję składają się dwie wystawy stałe:
1. Skarby Uniwersytetu Mikołaja Kopernika, w której znajdują się m.in.: antyczna ceramika z XVII/XV w. p.n.e. i kolekcja europejskiego malarstwa od XVI do XVIII wieku, zbiór ikon i rzeźb z okresu XVII-XIX wiek, rysunki z XVIII wieku, a także XIX-wieczne meble.
2. Sala Rektorów UMK - wystawa przedstawiająca poczet rektorów UMK i umieszczone w gablotach zabytkowe togi i insygnia rektorskie: berło, pierścień, łańcuch.

Zbiory muzeum dzielą się na cztery działy:
- sztuka polska w Wilnie i Toruniu,
- sztuka europejska i światowa oraz przedmioty kultury materialnej,
- świadectwa i pamiątki historii nauki w Wilnie i Toruniu,
- sztuka polska na świecie.

Poza ekspozycją wystaw stałych, Muzeum organizuje wystawy czasowe, propaguje sztukę narodową i kulturę oraz prowadzi działalność naukową i dydaktyczną.

Zdjęcie: Ananas96 [CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0)]