Celem ochrony rezerwatowej jest „zachowanie jeziora lobeliowego wraz z charakterystyczną roślinnością oraz cennymi gatunkami roślin i zwierząt”. Na terenie rezerwatu występują gatunki charakterystyczne dla tego typu zbiorników wodnych, w tym: lobelia jeziorna (Lobelia dortmanna), poryblin jeziorny (Isoëtes lacustris), brzeżyca jednokwiatowa (Littorella uniflora), wywłócznik skrętoległy (Myriophyllum alterniflorum), jeżogłówka pokrewna (Spharganium angustifolium), grążel żółty (Nuphar lutea), grzybienie białe (Nymphaea alba) oraz chroniona w ramach II załącznika unijnej dyrektywy siedliskowej elisma wodna (Luronim natans), a także cenne gatunki kręgowców i bezkręgowców, w tym sielawa europejska (Coregonus albula). Otoczenie stanowią strome wzniesienia morenowe porośnięte lasami bukowymi i bukowo-dębowymi oraz łąkami, poza zabudową na brzegu zachodnim i olszyną na brzegu północno-zachodnim. Jezioro Cechyńskie Małe ma pochodzenie wytopiskowe, jego głębokość sięga 19,7 metra, jest połączone strumykiem z Jeziorem Cechyńskim Wielkim i jeziorem Głęboczko.

Według planu ochrony ustalonego w 2013 na terenie rezerwatu ogranicza się meliorację, turystykę rekreacyjną i działalność rolniczą (poza istniejącą), zachowuje się stosunki wodne i hydrochemiczne. Na jego całym obszarze w ograniczonym stopniu można prowadzić połowy ryb, we wschodniej części udostępniono go dla celów edukacyjnych i turystycznych. Rezerwat nie posiada natomiast zadań ochronnych.






Opis skopiowano z wikipedii.