Świątynia składa się z dwóch połączonych ze sobą kościołów: starego wzniesionego w 1930 roku i nowego wzniesionego w latach 1972-1978 w stylu modernistycznym. Nowy kościół zbudowano w formie hali bez wyodrębnionego prezbiterium. Jest pierwszą świątynią wzniesioną w mieście po II Wojnie Światowej.

Zachowało się wyposażenie starej świątyni: ornamentalne polichromie namalowane na stropie przedsionka i na wspornikach ścian bocznych nawy głównej, organy i prospekt organowy, chrzcielnica z marmuru znajdująca się w przedsionku, dwa elementy witraża umieszczonego w owalnym oknie glównej nawy z przedstawieniem panoramy Szczecina z widoczną bazyliką archikatedralną św. Jakuba i zamkiem książąt pomorskich oraz ławki dla wiernych wykonane w I połowie XIX wieku. Obraz Chrystusa Miłosiernego i figurka Matki Bożej Fatimskiej należą do powojennego wyposażenia.
W 2010 roku kościół wpisano do rejestru zabytków.